Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp11Q02853 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp11Q02853 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms