Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cacna1sQ02789 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacna1sQ02789 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms