Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NfiaQ02780 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NfiaQ02780 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms