Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GscQ02591 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GscQ02591 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GscQ02591 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GscQ02591 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GscQ02591 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GscQ02591 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GscQ02591 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GscQ02591 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GscQ02591 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GscQ02591 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GscQ02591 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GscQ02591 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GscQ02591 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GscQ02591 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GscQ02591 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GscQ02591 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GscQ02591 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GscQ02591 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GscQ02591 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GscQ02591 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GscQ02591 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GscQ02591 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GscQ02591 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GscQ02591 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GscQ02591 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GscQ02591 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GscQ02591 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GscQ02591 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GscQ02591 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GscQ02591 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GscQ02591 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GscQ02591 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GscQ02591 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GscQ02591 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GscQ02591 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GscQ02591 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GscQ02591 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GscQ02591 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GscQ02591 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GscQ02591 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GscQ02591 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GscQ02591 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GscQ02591 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GscQ02591 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GscQ02591 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GscQ02591 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GscQ02591 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GscQ02591 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GscQ02591 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GscQ02591 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GscQ02591 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GscQ02591 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GscQ02591 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GscQ02591 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GscQ02591 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GscQ02591 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GscQ02591 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GscQ02591 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GscQ02591 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GscQ02591 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GscQ02591 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GscQ02591 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GscQ02591 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GscQ02591 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GscQ02591 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GscQ02591 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GscQ02591 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GscQ02591 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GscQ02591 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GscQ02591 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GscQ02591 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GscQ02591 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GscQ02591 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GscQ02591 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GscQ02591 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GscQ02591 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GscQ02591 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GscQ02591 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GscQ02591 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GscQ02591 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GscQ02591 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GscQ02591 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GscQ02591 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GscQ02591 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GscQ02591 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GscQ02591 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GscQ02591 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GscQ02591 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GscQ02591 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GscQ02591 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GscQ02591 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GscQ02591 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GscQ02591 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GscQ02591 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GscQ02591 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GscQ02591 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GscQ02591 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GscQ02591 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GscQ02591 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms