Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snai1Q02085 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snai1Q02085 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms