Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ly9Q01965 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ly9Q01965 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ly9Q01965 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms