Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec23aQ01405 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sec23aQ01405 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sec23aQ01405 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sec23aQ01405 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sec23aQ01405 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms