Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Top2aQ01320 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Top2aQ01320 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms