Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Grin2bQ01097 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Grin2bQ01097 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms