Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrcdQ00LT2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms