Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb2Q00977 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb2Q00977 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms