Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp1Q00915 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms