Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax8Q00288 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax8Q00288 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms