Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PgrQ00175 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PgrQ00175 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PgrQ00175 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PgrQ00175 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PgrQ00175 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PgrQ00175 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PgrQ00175 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PgrQ00175 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PgrQ00175 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PgrQ00175 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PgrQ00175 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PgrQ00175 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PgrQ00175 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PgrQ00175 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PgrQ00175 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PgrQ00175 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PgrQ00175 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PgrQ00175 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PgrQ00175 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PgrQ00175 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms