Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfdP97946 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfdP97946 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfdP97946 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfdP97946 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfdP97946 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfdP97946 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfdP97946 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfdP97946 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfdP97946 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfdP97946 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfdP97946 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfdP97946 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VegfdP97946 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms