Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
AlkP97793 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AlkP97793 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AlkP97793 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
AlkP97793 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AlkP97793 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AlkP97793 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
AlkP97793 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
AlkP97793 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AlkP97793 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AlkP97793 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
AlkP97793 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
AlkP97793 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
AlkP97793 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
AlkP97793 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AlkP97793 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
AlkP97793 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AlkP97793 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AlkP97793 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AlkP97793 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AlkP97793 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AlkP97793 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AlkP97793 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
AlkP97793 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AlkP97793 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AlkP97793 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AlkP97793 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AlkP97793 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AlkP97793 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AlkP97793 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AlkP97793 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AlkP97793 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AlkP97793 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
AlkP97793 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AlkP97793 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AlkP97793 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AlkP97793 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AlkP97793 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AlkP97793 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AlkP97793 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AlkP97793 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AlkP97793 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AlkP97793 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
AlkP97793 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
AlkP97793 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
AlkP97793 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
AlkP97793 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
AlkP97793 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AlkP97793 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AlkP97793 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AlkP97793 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AlkP97793 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AlkP97793 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AlkP97793 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AlkP97793 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AlkP97793 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AlkP97793 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AlkP97793 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AlkP97793 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AlkP97793 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AlkP97793 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AlkP97793 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AlkP97793 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AlkP97793 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AlkP97793 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AlkP97793 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AlkP97793 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AlkP97793 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AlkP97793 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AlkP97793 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AlkP97793 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AlkP97793 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AlkP97793 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AlkP97793 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AlkP97793 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AlkP97793 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
AlkP97793 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AlkP97793 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AlkP97793 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
AlkP97793 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AlkP97793 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AlkP97793 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AlkP97793 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
AlkP97793 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AlkP97793 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AlkP97793 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AlkP97793 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AlkP97793 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AlkP97793 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AlkP97793 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AlkP97793 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AlkP97793 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AlkP97793 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AlkP97793 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AlkP97793 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AlkP97793 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AlkP97793 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AlkP97793 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AlkP97793 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AlkP97793 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms