Protein–RNA interactions for Protein: P97766

Cfc1, Cryptic protein, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfc1P97766 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cfc1P97766 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfc1P97766 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms