Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pitx2P97474 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pitx2P97474 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms