Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1b3P97370 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1b3P97370 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1b3P97370 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1b3P97370 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1b3P97370 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1b3P97370 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1b3P97370 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1b3P97370 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1b3P97370 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1b3P97370 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1b3P97370 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1b3P97370 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1b3P97370 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1b3P97370 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b3P97370 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b3P97370 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms