Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1bP70700 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms