Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sycp3P70281 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sycp3P70281 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sycp3P70281 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms