Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Surf6P70279 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Surf6P70279 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Surf6P70279 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Surf6P70279 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Surf6P70279 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Surf6P70279 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Surf6P70279 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Surf6P70279 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Surf6P70279 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Surf6P70279 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Surf6P70279 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Surf6P70279 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Surf6P70279 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Surf6P70279 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Surf6P70279 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Surf6P70279 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf6P70279 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf6P70279 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf6P70279 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf6P70279 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf6P70279 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf6P70279 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf6P70279 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf6P70279 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Surf6P70279 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Surf6P70279 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms