Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Plxna3P70208 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plxna3P70208 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plxna3P70208 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plxna3P70208 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plxna3P70208 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plxna3P70208 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plxna3P70208 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plxna3P70208 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plxna3P70208 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plxna3P70208 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plxna3P70208 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plxna3P70208 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plxna3P70208 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plxna3P70208 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plxna3P70208 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plxna3P70208 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plxna3P70208 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plxna3P70208 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plxna3P70208 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plxna3P70208 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plxna3P70208 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plxna3P70208 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plxna3P70208 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plxna3P70208 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plxna3P70208 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Plxna3P70208 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms