Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta1P68134 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta1P68134 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acta1P68134 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acta1P68134 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta1P68134 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta1P68134 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta1P68134 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta1P68134 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta1P68134 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta1P68134 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta1P68134 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.5 ms