Protein–RNA interactions for Protein: P68033

Actc1, Actin, alpha cardiac muscle 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actc1P68033 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actc1P68033 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actc1P68033 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actc1P68033 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actc1P68033 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actc1P68033 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actc1P68033 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actc1P68033 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actc1P68033 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actc1P68033 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Actc1P68033 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Actc1P68033 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actc1P68033 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actc1P68033 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actc1P68033 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actc1P68033 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actc1P68033 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actc1P68033 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actc1P68033 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actc1P68033 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actc1P68033 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actc1P68033 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actc1P68033 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actc1P68033 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actc1P68033 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actc1P68033 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actc1P68033 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actc1P68033 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actc1P68033 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actc1P68033 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Actc1P68033 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actc1P68033 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Actc1P68033 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actc1P68033 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actc1P68033 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Actc1P68033 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actc1P68033 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actc1P68033 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms