Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpnP63163 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnrpnP63163 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms