Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms