Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp2P63044 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms