Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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