Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsnl1P62761 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms