Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms