Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Copz1P61924 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copz1P61924 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copz1P61924 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copz1P61924 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copz1P61924 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copz1P61924 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copz1P61924 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Copz1P61924 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms