Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnnP61807 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnnP61807 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnnP61807 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnnP61807 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnnP61807 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnnP61807 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnnP61807 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnnP61807 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnnP61807 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnnP61807 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnnP61807 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnnP61807 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnnP61807 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnnP61807 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnnP61807 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnnP61807 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnnP61807 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnnP61807 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnnP61807 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnnP61807 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SnnP61807 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnnP61807 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnnP61807 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnnP61807 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnnP61807 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnnP61807 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnnP61807 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnnP61807 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnnP61807 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnnP61807 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnnP61807 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SnnP61807 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SnnP61807 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnnP61807 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnnP61807 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnnP61807 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnnP61807 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnnP61807 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnnP61807 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnnP61807 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnnP61807 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnnP61807 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnnP61807 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnnP61807 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnnP61807 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SnnP61807 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnnP61807 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnnP61807 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnnP61807 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnnP61807 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnnP61807 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnnP61807 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnnP61807 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnnP61807 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnnP61807 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnnP61807 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SnnP61807 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnnP61807 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnnP61807 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnnP61807 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnnP61807 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SnnP61807 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnnP61807 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnnP61807 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnnP61807 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnnP61807 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnnP61807 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnnP61807 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnnP61807 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnnP61807 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnnP61807 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnnP61807 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnnP61807 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnnP61807 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnnP61807 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SnnP61807 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnnP61807 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnnP61807 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SnnP61807 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SnnP61807 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnnP61807 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnnP61807 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnnP61807 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnnP61807 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnnP61807 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnnP61807 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnnP61807 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnnP61807 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnnP61807 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnnP61807 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnnP61807 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnnP61807 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnnP61807 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnnP61807 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnnP61807 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnnP61807 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnnP61807 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnnP61807 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnnP61807 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms