Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga11P61622 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga11P61622 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga11P61622 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga11P61622 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga11P61622 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itga11P61622 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga11P61622 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga11P61622 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga11P61622 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga11P61622 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itga11P61622 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms