Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smg6P61406 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smg6P61406 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smg6P61406 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smg6P61406 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smg6P61406 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smg6P61406 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smg6P61406 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smg6P61406 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smg6P61406 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smg6P61406 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms