Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf3P61205 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf3P61205 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf3P61205 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf3P61205 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf3P61205 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf3P61205 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf3P61205 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf3P61205 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf3P61205 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf3P61205 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf3P61205 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf3P61205 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf3P61205 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arf3P61205 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms