Protein–RNA interactions for Protein: P61025

Cks1b, Cyclin-dependent kinases regulatory subunit 1, mousemouse

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cks1bP61025 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cks1bP61025 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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