Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b6P59708 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms