Protein–RNA interactions for Protein: P59108

Cpne2, Copine-2, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne2P59108 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne2P59108 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne2P59108 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms