Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pcbp4P57724 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pcbp4P57724 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms