Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5bP56480 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp5bP56480 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms