Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab4aP56371 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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