Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtskP55097 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtskP55097 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtskP55097 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtskP55097 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtskP55097 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtskP55097 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtskP55097 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CtskP55097 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtskP55097 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtskP55097 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CtskP55097 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtskP55097 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtskP55097 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CtskP55097 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtskP55097 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtskP55097 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtskP55097 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CtskP55097 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtskP55097 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtskP55097 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtskP55097 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtskP55097 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtskP55097 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtskP55097 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtskP55097 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtskP55097 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtskP55097 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtskP55097 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtskP55097 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtskP55097 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtskP55097 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtskP55097 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtskP55097 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtskP55097 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtskP55097 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtskP55097 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtskP55097 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtskP55097 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtskP55097 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtskP55097 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtskP55097 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtskP55097 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtskP55097 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtskP55097 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtskP55097 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtskP55097 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtskP55097 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtskP55097 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtskP55097 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtskP55097 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtskP55097 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtskP55097 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtskP55097 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtskP55097 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtskP55097 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtskP55097 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtskP55097 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtskP55097 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtskP55097 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CtskP55097 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtskP55097 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtskP55097 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtskP55097 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtskP55097 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtskP55097 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtskP55097 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtskP55097 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtskP55097 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtskP55097 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtskP55097 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CtskP55097 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtskP55097 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtskP55097 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtskP55097 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtskP55097 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtskP55097 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtskP55097 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtskP55097 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtskP55097 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtskP55097 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtskP55097 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtskP55097 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtskP55097 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtskP55097 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtskP55097 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtskP55097 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtskP55097 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtskP55097 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtskP55097 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtskP55097 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtskP55097 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtskP55097 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtskP55097 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtskP55097 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtskP55097 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtskP55097 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CtskP55097 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtskP55097 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtskP55097 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms