Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Aqp4P55088 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms