Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Faf1P54731 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Faf1P54731 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Faf1P54731 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Faf1P54731 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Faf1P54731 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Faf1P54731 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms