Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rad23bP54728 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad23bP54728 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad23bP54728 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms