Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cux1P53564 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cux1P53564 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cux1P53564 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cux1P53564 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cux1P53564 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cux1P53564 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cux1P53564 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cux1P53564 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms