Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Map3k1P53349 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Map3k1P53349 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Map3k1P53349 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Map3k1P53349 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Map3k1P53349 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms