Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccr4P51680 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms