Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl5P50228 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms